Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp944E9PUS4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp944E9PUS4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zfp944E9PUS4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms