Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc13D3YV10 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc13D3YV10 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332 ms