Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930444P10RikD3YUR1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms