Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud4B2RRE7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud4B2RRE7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud4B2RRE7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 554.3 ms