Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60bB1B212 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60bB1B212 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60bB1B212 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms