Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm6880A3KG45 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms