Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc38A2VDH3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc38A2VDH3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc38A2VDH3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms