Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm27029A2A4P4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm27029A2A4P4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm27029A2A4P4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 447.1 ms