Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ino80eA0A0U1RP99 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms