Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsc22d3Q9Z2S7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms