Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nup160Q9Z0W3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nup160Q9Z0W3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nup160Q9Z0W3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms