Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc1bQ9WV32 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arpc1bQ9WV32 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms