Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cry2Q9R194 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cry2Q9R194 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cry2Q9R194 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms