Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plod3Q9R0E1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plod3Q9R0E1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Plod3Q9R0E1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms