Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Plod2Q9R0B9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod2Q9R0B9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod2Q9R0B9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms