Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11aQ9QYE3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bcl11aQ9QYE3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11aQ9QYE3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11aQ9QYE3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11aQ9QYE3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11aQ9QYE3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcl11aQ9QYE3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms