Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntn6Q9JMB8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn6Q9JMB8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn6Q9JMB8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms