Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gkap1Q9JMB0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms