Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms