Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col5a3Q9JLI2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col5a3Q9JLI2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a3Q9JLI2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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