Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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