Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Bco1Q9JJS6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Bco1Q9JJS6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Bco1Q9JJS6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco1Q9JJS6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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