Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc22Q9JIG7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc22Q9JIG7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms