Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Cldn19Q9ET38 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn19Q9ET38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Cldn19Q9ET38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Cldn19Q9ET38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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