Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc17Q9ESX4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zcchc17Q9ESX4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc17Q9ESX4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms