Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xab2Q9DCD2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms