Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med29Q9DB91 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms