Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlirpQ9D8T7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SlirpQ9D8T7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms