Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Alkbh4Q9D8F1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh4Q9D8F1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms