Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhl40Q9D783 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl40Q9D783 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms