Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D5Q8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9D5Q8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D5Q8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms