Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc105Q9D4K7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms