Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Efhd1Q9D4J1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efhd1Q9D4J1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms