Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933402E13RikQ9D4D2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402E13RikQ9D4D2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms