Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930548H24RikQ9D496 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930548H24RikQ9D496 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930548H24RikQ9D496 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930548H24RikQ9D496 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms