Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spns3Q9D232 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms