Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chordc1Q9D1P4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chordc1Q9D1P4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms