Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1K7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1K7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1K7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D1K7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1K7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1K7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D1K7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D1K7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1K7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1K7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1K7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1K7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1K7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms