Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lsm12Q9D0R8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lsm12Q9D0R8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lsm12Q9D0R8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lsm12Q9D0R8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lsm12Q9D0R8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lsm12Q9D0R8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lsm12Q9D0R8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lsm12Q9D0R8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms