Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prpsap1Q9D0M1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prpsap1Q9D0M1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms