Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shisa9Q9CZN4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa9Q9CZN4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms