Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Exo5Q9CXP9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Exo5Q9CXP9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms