Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prkrip1Q9CWV6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prkrip1Q9CWV6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms