Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gps1Q99LD4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gps1Q99LD4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms