Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TriobpQ99KW3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TriobpQ99KW3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TriobpQ99KW3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms