Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ciao1Q99KN2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms