Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krcc1Q99JT5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krcc1Q99JT5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krcc1Q99JT5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms