Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Synpo2Q91YE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms