Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cabp4Q8VHC5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cabp4Q8VHC5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms