Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg8Q8VE18 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg8Q8VE18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg8Q8VE18 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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